义军内部也闹过一次分裂，有一部分人仍旧希望从海盗那里租用一些船，去荷兰人势力相对更弱一些的婆罗洲，成就一番大事。他们觉得在万隆地区没有发展，荷兰人的势力太强，当初说好了站稳脚跟之后，若是不愿意一起干，就各自分道扬镳。
比如在队伍里相当有威望的黄班，他就想着找海盗租船去婆罗洲，带着自己的心腹兄弟。一来是对前途的构想不同，二来是他觉得牛二兄弟身边的人越来越多，他们这些人的地位很尴尬：打仗确实不如他们，论关系人脉人家能弄到枪炮，一些机密事也并不和他商量。
于是，在他提出想要带着弟兄们去婆罗洲成就一番大事的时候，他死了。
故事很简单，如同大顺开过故事里，太祖皇帝袭杀曹操和革里眼的故事无二。
一场针对那些想要去往婆罗洲的人的大清洗之后，义军的战斗力不但没有下降，反而完成了制度化建设，按照威海小站练兵的操典训练出了一支可以与荷兰人野战对射的军队。
军火器械金银，自有人时不时通过英国东印度公司的船送来。大量聚集在这里的华人，也都安排了屯垦种植，在原本的爪哇人领地也实行了编户齐民和破村社分社田的运动。
若是在天朝乱世，这便有些“摆脱流寇，稳固政权，有问鼎天下之势”的意思了。
殖民者有时候是有双重使命的，一方面是对旧制度的破坏，另一方面是按照殖民者的需求对社会进行改造。
荷兰人在巴达维亚日久，给万隆地区带来的巨大改变，就是原始村社逐步瓦解。而这种瓦解，也使得大顺枢密院这边派过来人，更容易开战工作：干别的，他们或许没经验，但按照大顺开国之前那一套均田、屯田、建设政权的思路，他们还是很熟悉的。
凭借着外部资金的支持，以及庞大的超额的军官团和低阶官员储备，实际上整个万隆地区，已经完成了改土归流。
这是南洋四军镇计划之内的事情，巴达维亚中转港的地位一旦消失，想要维系爪哇军镇，就必须要把重点从巴达维亚这座城，转向更广阔的地区。
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